博士点基金：生物材料（林昌健）7万（2003～2005）
博士点基金：纳米结构（毛秉伟）7万（2003～2005）
国家基金：新型合成氨钌基催化剂及其催化作用机理（廖代伟）22万（2003～2005）
国家基金：生物活性材料/生物环境界面过程本质机理的研究（林昌健）22万（2003～2005）
国家基金：碳纳米管化学修饰的理论探讨（吕鑫）22万（2003～2005）
国家基金：用于纳米尺度异质结物性测量的纳电极限域性方法（毛秉伟）25万（2003～2005）
国家基金：从原子到纳米尺度铁物种的构筑及其烯烃环氧化催化性能（王野）22万（2003～2005）
国家基金：团簇生长的催化效应（郑兰荪）24万（2003～2005）
国家基金纳米科技基础研究重大计划：低维纳米材料表面体系的增强和异常光学效应及基础研究（孙世刚）80万（2003～2006）
国家基金纳米科技基础研究重大计划：低维纳米体系量子限域效应的理论研究（张乾二）80万（2003～2006）
国家基金重点项目：光化学反应的基础理论研究(与北京师范大学、南京大学合作)（曹泽星）150.0(30.0)万（2003～2006）
国家杰出青年科学基金：复杂体系中的价键理论方法（吴玮）80万（2003～2006）
国家重点基础研究发展规划(973)项目前期研究专项基金：团簇材料的化学组装（郑兰荪）80万（2003～2005）
国家自然科学基金重点项目一级子课题：脑功能物质的探索～有关分子间多量子跃迁(多量子相干)（陈忠）50万（2003～2005）
教育部重点项目：复杂体系的理论化学组合方法研究（吴玮）10万（2003～2005）
市基金重点项目：纳米纤维（林昌健）30万（2003～2005）
国家自然科学基金面上项目：生物碱类兴奋剂的固态电致化学发光研究（陈曦）22万（2003～2006）
第一军医大学：叶片药残表面荧光分析（李耀群）3万（2003～2004）
省基金：渔药残留非标记荧光检测技术的研究（郭祥群）3.9万（2003～2005）
国家基金委、教育部：国家基地创名牌课程（郭祥群）6万（2003～2004）
福建省重大科技项目：蔬菜中有机氯农药固相微萃取速测技术的研究（陈曦）40万（2003～2005）
厦门市科技局：大气污染历史监测新技术（王秋泉）10万（2003～2005）
国家自然科学基金面上项目：一类新型光学探针的新检测原理及其应用研究（许金钩）22万（2003～2005）
国家自然科学基金委重点项目：中药药药组分的指纹图谱分析方法研究（王小如）50万（2003～2006）
教育部博士点基金：应用于元素形态分析的高效毛细管色谱分离（黄本立）5万（2003～2004）
